2017.07.13
| 开讲学部 | 理工学研究科 |
| 科目名 | バイオデータ解析 |
| 担当教员 | 根本航?田中眞人 |
大学院生向け开讲科目であるため、受讲生は多様な分野の研究室に所属している。専门分野の异なる学生同士が、グループ内で协力しあうことで、お互いの理解を补いあい、独力では取り组みえない问题を设定し、解决を目指すことを意図している。
【グループ分け】
受讲生9名を5名と4名のグループに分けた。本讲义では基本的な计算机操作に加え、场合によってはプログラミングスキルを必要とする场合もある。グループ分けに际しては、计算机操作に习熟している2名を别々のグループに所属させた。また可能な限り异なる研究室に所属する学生を同グループに所属させた。
【授业环境】
9月上旬にデータ解析の基础を学んでもらうための7コマの讲义を実施した。その后、必要に応じて解析方法の讲义をはさみながら、グループ学习を通して最终発表のための準备を进め、1月下旬に最终発表会を开催した。
【问题提示方法】
次世代シーケンサーで解読されたゲノム配列のショートリードデータを贵础厂罢蚕形式で配布した。どこの国の谁に由来するデータであるかは秘匿した。「このゲノムを有する个人はどのような人だろうか?『どのような』をどう解釈するかはグループごとに判断すること」と问うた。
【成果発表方法】
持ち时间最低30分のプレゼンテーションを行わせた。メンバー全员が必ず発表することとした。
プレゼンテーション:レポート:讲义への参加?取り组み状况=60:20:20
【プレゼンテーション】
2グループ间対抗で行わせ、教员と罢础が採点を行った。解析データの解釈の正しさを重视した。
【ライティング】
グループ学习に入る前の段阶で、ゲノムデータを利用してどのような解析ができるかについての调査レポートを提出させ、调査量に応じて、5段阶评価を行った。
1.大学院生が复数人集まって议论する场の学系内での确保
2.秋?冬にかけて学会が集中するため、その前に集中讲义を终了する
3.解析内容が类似する倾向にあるため、多様な目标设定を促す仕组みの构筑
4.今年度については、共同で一つの解析を行うのではなく、メンバーそれぞれが异なる解析を行う倾向にあったため、共同作业をうながす仕组みの构筑
履修者が
1. ゲノムデータを取り扱えるようになる。
2. タンパク質データを取り扱えるようになる。
3. 遺伝子発現データを取り扱えるようになる。
4. 低分子データを取り扱えるようになる。
5. データの可視化ができるようになる。
6. ばらつきのあるデータの取り扱えるようになる。
7. ブラインドタッチに習熟する
8. UNIX/Linux 環境でのコマンドライン操作に触れる
9. スクリプト言語による初歩的なプログラミングに触れる
10. オープンソースソフトウェアのダウンロードとインストールができるようになる
第1回:ガイダンス
第2回:解析ツールのインストール
第3回:狈骋厂データ解析
第4回:统计解析基础
第5回:バイオ関连データベース実习
第6回:バイオデータ解析ツール実习
第7回:笔测迟丑辞苍による解析基础1(入出力、基本的な関数)
第8回:グループワーク(解析の方向性について议论)
第9回:笔测迟丑辞苍による解析基础2(各种バイオデータのフォーマットの理解とデータの抜き出し)
第10回:グループワーク2(解析の方向性の决定)
〇笔叠尝を主体とした教育への取组みに対する支援(笔叠尝教育支援プログラム学内公募)
东京电机大学教育改善推進室では、平成23年度から「学生が主体となって学ぶ」形式を取り入れた、いわゆる「PBL(Problem-Based Learning又はProject-Based Learning)」による教育の開発?運営を「PBL教育支援プログラム」として支援し推進しています。
笔叠尝教育支援プログラムは、これから笔叠尝を取り入れていこうと考えている教员やすでに実践している笔叠尝をさらに工夫しようと考えている科目を対象に支援を行い、その実践と成果を学内の関係者と共有し、学生の学びを主体とした教育の推进を図ることを目的としています。